Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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PTP4A2Q12974 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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PTP4A2Q12974 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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PTP4A2Q12974 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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PTP4A2Q12974 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTP4A2Q12974 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
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