Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF5Q12774 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms