Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYP4F3Q08477 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms