Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA3Q08378 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA3Q08378 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms