Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNDQ07001 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms