Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC9Q06265 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms