Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN11Q06124 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms