Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP1Q04837 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP1Q04837 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP1Q04837 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP1Q04837 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP1Q04837 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP1Q04837 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP1Q04837 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP1Q04837 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP1Q04837 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP1Q04837 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP1Q04837 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP1Q04837 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP1Q04837 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP1Q04837 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms