Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms