Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms