Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms