Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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TMEM258P61165 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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TMEM258P61165 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TMEM258P61165 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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