Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEFA1P59665 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms