Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00313P59037 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms