Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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