Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN15P56746 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms