Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARFIP2P53365 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms