Protein–RNA interactions for Protein: P51610

HCFC1, Host cell factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1P51610 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HCFC1P51610 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms