Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ETV1P50549 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ETV1P50549 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms