Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP153P49790 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP153P49790 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP153P49790 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP153P49790 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP153P49790 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP153P49790 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP153P49790 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP153P49790 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP153P49790 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP153P49790 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP153P49790 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP153P49790 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP153P49790 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP153P49790 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP153P49790 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP153P49790 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP153P49790 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP153P49790 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP153P49790 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP153P49790 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP153P49790 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP153P49790 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP153P49790 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP153P49790 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP153P49790 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP153P49790 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP153P49790 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP153P49790 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP153P49790 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP153P49790 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NUP153P49790 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NUP153P49790 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP153P49790 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP153P49790 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP153P49790 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP153P49790 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP153P49790 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP153P49790 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP153P49790 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP153P49790 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP153P49790 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP153P49790 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP153P49790 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP153P49790 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP153P49790 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP153P49790 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP153P49790 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP153P49790 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP153P49790 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP153P49790 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP153P49790 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP153P49790 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP153P49790 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP153P49790 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP153P49790 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP153P49790 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP153P49790 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP153P49790 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms