Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSEN1P49768 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.8 ms