Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB2P29033 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJB2P29033 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJB2P29033 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJB2P29033 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJB2P29033 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJB2P29033 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB2P29033 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB2P29033 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GJB2P29033 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJB2P29033 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJB2P29033 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJB2P29033 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJB2P29033 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GJB2P29033 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms