Protein–RNA interactions for Protein: P29016

CD1B, T-cell surface glycoprotein CD1b, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1BP29016 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD1BP29016 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD1BP29016 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD1BP29016 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD1BP29016 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD1BP29016 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD1BP29016 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD1BP29016 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD1BP29016 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD1BP29016 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD1BP29016 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms