Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IL3RAP26951 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms