Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms