Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XBP1P17861 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XBP1P17861 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
XBP1P17861 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XBP1P17861 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XBP1P17861 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XBP1P17861 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XBP1P17861 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
XBP1P17861 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
XBP1P17861 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
XBP1P17861 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
XBP1P17861 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
XBP1P17861 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XBP1P17861 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
XBP1P17861 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XBP1P17861 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XBP1P17861 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
XBP1P17861 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XBP1P17861 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XBP1P17861 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
XBP1P17861 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
XBP1P17861 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
XBP1P17861 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
XBP1P17861 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XBP1P17861 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XBP1P17861 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
XBP1P17861 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
XBP1P17861 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms