Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms