Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8BP10966 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8BP10966 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8BP10966 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8BP10966 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8BP10966 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8BP10966 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8BP10966 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8BP10966 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8BP10966 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8BP10966 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8BP10966 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8BP10966 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8BP10966 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8BP10966 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8BP10966 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8BP10966 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8BP10966 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms