Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGA3P0DJD8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms