Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2BP0DI82 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms