Protein–RNA interactions for Protein: O95264

HTR3B, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3BO95264 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR3BO95264 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms