Protein–RNA interactions for Protein: O75920

SERF1A, Small EDRK-rich factor 1, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1AO75920 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERF1AO75920 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SERF1AO75920 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERF1AO75920 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERF1AO75920 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERF1AO75920 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERF1AO75920 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERF1AO75920 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERF1AO75920 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERF1AO75920 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERF1AO75920 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERF1AO75920 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERF1AO75920 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERF1AO75920 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERF1AO75920 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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