Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRAMEF2O60811 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRAMEF2O60811 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms