Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIAH2O43255 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms