Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AGRNO00468 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AGRNO00468 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AGRNO00468 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AGRNO00468 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AGRNO00468 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AGRNO00468 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AGRNO00468 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
AGRNO00468 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AGRNO00468 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AGRNO00468 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
AGRNO00468 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AGRNO00468 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AGRNO00468 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
AGRNO00468 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
AGRNO00468 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
AGRNO00468 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
AGRNO00468 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
AGRNO00468 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
AGRNO00468 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
AGRNO00468 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
AGRNO00468 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
AGRNO00468 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
AGRNO00468 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
AGRNO00468 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
AGRNO00468 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AGRNO00468 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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