Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H7C1D1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1D1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1D1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1D1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1D1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1D1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1D1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1D1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1D1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1D1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1D1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1D1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1D1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1D1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1D1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1D1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1D1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C1D1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C1D1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C1D1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H7C1D1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms