Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRRM3A6NNA2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRRM3A6NNA2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms