Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPACA6W5XKT8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPACA6W5XKT8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPACA6W5XKT8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms