Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R4GMQ9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R4GMQ9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R4GMQ9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R4GMQ9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R4GMQ9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
R4GMQ9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R4GMQ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
R4GMQ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R4GMQ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R4GMQ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R4GMQ9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R4GMQ9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R4GMQ9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
R4GMQ9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R4GMQ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
R4GMQ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
R4GMQ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R4GMQ9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
R4GMQ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R4GMQ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R4GMQ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
R4GMQ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
R4GMQ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R4GMQ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R4GMQ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
R4GMQ9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
R4GMQ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R4GMQ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R4GMQ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R4GMQ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R4GMQ9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R4GMQ9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R4GMQ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
R4GMQ9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
R4GMQ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R4GMQ9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R4GMQ9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
R4GMQ9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R4GMQ9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
R4GMQ9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
R4GMQ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
R4GMQ9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
R4GMQ9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
R4GMQ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
R4GMQ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
R4GMQ9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
R4GMQ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
R4GMQ9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R4GMQ9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R4GMQ9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
R4GMQ9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
R4GMQ9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
R4GMQ9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
R4GMQ9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
R4GMQ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
R4GMQ9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
R4GMQ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R4GMQ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R4GMQ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R4GMQ9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
R4GMQ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R4GMQ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R4GMQ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R4GMQ9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
R4GMQ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R4GMQ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
R4GMQ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R4GMQ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R4GMQ9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R4GMQ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
R4GMQ9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R4GMQ9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R4GMQ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R4GMQ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
R4GMQ9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R4GMQ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R4GMQ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
R4GMQ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
R4GMQ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
R4GMQ9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
R4GMQ9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
R4GMQ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
R4GMQ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
R4GMQ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
R4GMQ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
R4GMQ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R4GMQ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
R4GMQ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R4GMQ9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R4GMQ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R4GMQ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
R4GMQ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
R4GMQ9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
R4GMQ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
R4GMQ9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
R4GMQ9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
R4GMQ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
R4GMQ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
R4GMQ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms