Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD3Q9Y597 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD3Q9Y597 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD3Q9Y597 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms