Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.13■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC48.13■■■■■ 5.3
DCAF1Q9Y4B6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC48.12■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC48.11■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC48.11■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.1■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.1■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC48.1■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC48.09■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC48.09■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.08■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
DCAF1Q9Y4B6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
DCAF1Q9Y4B6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
DCAF1Q9Y4B6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC48.05■■■■■ 5.28
DCAF1Q9Y4B6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.04■■■■■ 5.28
DCAF1Q9Y4B6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
DCAF1Q9Y4B6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC48.02■■■■■ 5.28
DCAF1Q9Y4B6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC48.02■■■■■ 5.28
DCAF1Q9Y4B6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC48.02■■■■■ 5.28
DCAF1Q9Y4B6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
DCAF1Q9Y4B6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.28
DCAF1Q9Y4B6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.28
DCAF1Q9Y4B6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC47.99■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC47.99■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC47.98■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC47.97■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC47.97■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC47.97■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC47.96■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC47.95■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC47.95■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC47.94■■■■■ 5.27
DCAF1Q9Y4B6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC47.94■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC47.94■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.94■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.92■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC47.91■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC47.91■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC47.9■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC47.89■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.89■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC47.88■■■■■ 5.26
DCAF1Q9Y4B6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC47.87■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC47.87■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC47.86■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC47.86■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC47.86■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC47.86■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC47.85■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC47.84■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.84■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC47.84■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC47.84■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.83■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC47.83■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
DCAF1Q9Y4B6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.81■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC47.81■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC47.81■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC47.81■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
DCAF1Q9Y4B6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC47.8■■■■■ 5.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms