Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFE2L3Q9Y4A8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NFE2L3Q9Y4A8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NFE2L3Q9Y4A8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
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