Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HCC1Q9Y3T6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.56■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms