Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT52Q9Y366 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT52Q9Y366 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms