Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSUH2Q9Y2M2 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSUH2Q9Y2M2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms