Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERGIC3Q9Y282 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERGIC3Q9Y282 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERGIC3Q9Y282 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms