Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y232

CDYL, Chromodomain Y-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDYLQ9Y232 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDYLQ9Y232 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDYLQ9Y232 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CDYLQ9Y232 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDYLQ9Y232 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDYLQ9Y232 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms