Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR1

ZNF148, Zinc finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF148Q9UQR1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF148Q9UQR1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF148Q9UQR1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF148Q9UQR1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF148Q9UQR1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF148Q9UQR1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF148Q9UQR1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF148Q9UQR1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF148Q9UQR1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF148Q9UQR1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF148Q9UQR1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms