Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP22Q9UPT9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP22Q9UPT9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP22Q9UPT9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms