Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC8A2Q9UPR5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC8A2Q9UPR5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC8A2Q9UPR5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms